А почему к финноязычным топонимам это относится, а к эстонским нет? Остров Сааремаа склоняется?
Или если с Сааремаа в Хельсинки, но и с Сааремаы в Таллинн? Нормально так, а что.
Таллин(н) не при делах из-за окончания на согласную.
Без вариантов склоняется. Женские склоняются в случае изменения носителями русского языка имени собственного путём замещения корня на типично русское родовое окончание -а, -я и/или частого употребления этого собственного в русском - Верона, Венеция, Савонлинна.
Всё, что имеет полное заимствование и оканчивается на удвоенные гласные, либо на -о, -у, -и, не склоняется. Сааремаа, Вантаа, Куусамо, Палермо, Хаапсалу.
Можно сколько угодно декретом убирать вторую Н у столицы Эстонии, даже установить такое написание как правило, но ноги растут именно из нежелания услышать оригинал. Париж это проходил немного раньше:)