M_R, суть КТ и МРТ одна и та же - получение послойной информации о структурах человеческого тела. Различия в разрешающей способности есть (в пользу МРТ), но очень небольшие. Их основное различие - в методе получения информации. КТ - рентген, МРТ - электромагнитное поле.
Аппараты КТ дешевле в силу того, что источники рентгеновского излучения дешевле. К тому же, единственным противопоказанием к КТ является лейкоз или лучевая болезнь. К МРТ намного больше противопоказаний - любые импланты и кардиостимуляторы, к примеру. Зато благодаря тому, что воздействие ЭМП на организм намного менее губительно, чем рентгена, МРТ позволяет получать картину в динамике, к примеру, работу сердца или ангиограмму сосудов в работе. КТ не позволяет такого в силу лучевой нагрузки.
Вот, собссно, и различия =)))