Яндекс-транспорт - отличная вещь, но:
-есть машины без маячков глонасс - он их не видит вообще;
-есть некоторые филиалы Мосгортранса, маршруты которых показываются исходя из базы расписаний, а не реального движения;
-"нулевые" рейсы показываются только на участке, совпадающем с основным маршрутом;
-рейсы для постановки в график не по маршруту (скажем, Тм 39 до Черемушек), скорее всего, не показываются на участке, где произошло отклонение от маршрута;
-"нулевой" рейс без пассажиров, проходящий частично по маршруту, показывается как обычный рейс;
-обновление картинки раз в 5 минут, остальное - интерполяция, поэтому до 1-2 минут в любую сторону погрешность;
-если вы стоите около конечной, то яндекс-транспорт не скажет, что и через какое время выйдет с этой конечной. И даже если на соседней остановке, есть риск, что яндекс увидит автобус только когда вы уже в нем уедете (или когда, плюнув, пойдете пешком, а автобус просвистит мимо);
-некоторые маршруты по выходным, а то и вообще обслуживается фиатами, и есть риск, что вашей команде в этом фиате просто не будет места, здесь ни яндекс-транспорт, ни карта вам не помогут.